Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms