Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6040Q4QY32 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6040Q4QY32 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms