Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbof1Q3V079 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms