Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc38a11Q3USY0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms