Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B3gnt6Q3USF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms