Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm20Q3UQS8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms