Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem241Q3UME2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem241Q3UME2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms