Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prmt9Q3U3W5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt9Q3U3W5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms