Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc13Q3TIR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms