Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcerg1lQ3B807 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1lQ3B807 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms