Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp1aQ2LKU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms