Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms