Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3ip1Q149C2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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