Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 HEM3YDL205C 984 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 BUD32YGR262C 786 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SPC24YMR117C 642 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 HOR7YMR251W-A 180 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SNN1YNL086W 309 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YOL035CYOL035C 303 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 CLD1YGR110W 1338 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 HPF1YOL155C 2904 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RGT1YKL038W 3513 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 ECM3YOR092W 1842 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 UBC11YOR339C 471 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 UIP4YPL186C 915 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 UTP4YDR324C 2331 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 ATG32YIL146C 1590 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 VTC2YFL004W 2487 nt5.12□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 UTP9YHR196W 1728 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RFA1YAR007C 1866 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RAT1YOR048C 3021 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 UGX2YDL169C 672 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YDR053WYDR053W 396 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 AAD6YFL056C 639 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SNZ3YFL059W 897 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SNZ2YNL333W 897 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 snR34snR34 203 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 HER2YMR293C 1395 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 DDC1YPL194W 1839 nt5.11□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SRP101YDR292C 1866 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YGR176WYGR176W 348 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 MPM1YJL066C 759 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 ASK1YKL052C 879 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 APN1YKL114C 1104 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YMR114CYMR114C 1107 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SEC17YBL050W 879 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 NOP2YNL061W 1857 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SUE1YPR151C 621 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 PDH1YPR002W 1551 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SAS4YDR181C 1446 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SEC12YNR026C 1416 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 MDH3YDL078C 1032 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YER010CYER010C 705 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YIL060WYIL060W 435 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 ECM19YLR390W 339 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RPS9AYPL081W 594 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 ERI1YPL096C-A 207 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YPR098CYPR098C 486 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YME1YPR024W 2244 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 SIT1YEL065W 1887 nt5.09□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MPC54YOR177C 1395 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YEL028WYEL028W 462 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YEL074WYEL074W 339 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 VAM7YGL212W 951 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 RHO3YIL118W 696 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 DOM34YNL001W 1161 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 NCE103YNL036W 666 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YPL014WYPL014W 1146 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YBR144CYBR144C 315 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 VRP1YLR337C 2454 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 STL1YDR536W 1710 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MNS1YJR131W 1650 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MNN2YBR015C 1794 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YKL031WYKL031W 414 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YKR073CYKR073C 321 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SKG1YKR100C 1068 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 CIN4YMR138W 576 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 PGA2YNL149C 390 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YNL234WYNL234W 1281 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 NDJ1YOL104C 1059 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YPL102CYPL102C 303 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MRPL36YBR122C 534 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 PDC1YLR044C 1692 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SKS1YPL026C 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 PRP46YPL151C 1356 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MSA2YKR077W 1092 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 PRI2YKL045W 1587 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 RAD53YPL153C 2466 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 FET3YMR058W 1911 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 CCZ1YBR131W 2115 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ADE12YNL220W 1302 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 snR57snR57 88 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 RTN1YDR233C 888 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 EDC1YGL222C 528 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YGR066CYGR066C 879 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 FES1YBR101C 873 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 PDB1YBR221C 1101 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 BUL1YMR275C 2931 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 VAN1YML115C 1608 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MST1YKL194C 1389 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ISN1YOR155C 1353 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SRV2YNL138W 1581 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ACC1YNR016C 6702 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SIT4YDL047W 936 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 APS3YJL024C 585 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ADD66YKL206C 804 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 VTA1YLR181C 993 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SIA1YOR137C 1869 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YEL077CYEL077C 3834 nt5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms