Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk16Q04735 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk16Q04735 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms