Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcad1Q04692 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms