Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms