Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1Q01822 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms