Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F8a1Q00558 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms