Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx1P81068 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx1P81068 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx1P81068 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx1P81068 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Irx1P81068 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms