Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stra8P70278 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stra8P70278 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stra8P70278 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stra8P70278 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra8P70278 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms