Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba52P62984 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba52P62984 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uba52P62984 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms