Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps27aP62983 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps27aP62983 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms