Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ActbP60710 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ActbP60710 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ActbP60710 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ActbP60710 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ActbP60710 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ActbP60710 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ActbP60710 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ActbP60710 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ActbP60710 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ActbP60710 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ActbP60710 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ActbP60710 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ActbP60710 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ActbP60710 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ActbP60710 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ActbP60710 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ActbP60710 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ActbP60710 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ActbP60710 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ActbP60710 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms