Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdrg1P59048 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms