Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c39P56656 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c39P56656 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp2c39P56656 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp2c39P56656 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c39P56656 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms