Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms