Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp1P55194 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1P55194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms