Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ClgnP52194 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClgnP52194 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms