Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa13P50711 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms