Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CratP47934 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CratP47934 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CratP47934 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CratP47934 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CratP47934 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CratP47934 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CratP47934 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CratP47934 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CratP47934 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CratP47934 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CratP47934 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CratP47934 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CratP47934 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CratP47934 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CratP47934 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CratP47934 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CratP47934 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CratP47934 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CratP47934 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CratP47934 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CratP47934 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CratP47934 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CratP47934 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CratP47934 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CratP47934 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CratP47934 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CratP47934 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CratP47934 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CratP47934 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CratP47934 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CratP47934 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CratP47934 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CratP47934 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CratP47934 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CratP47934 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CratP47934 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CratP47934 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CratP47934 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CratP47934 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CratP47934 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CratP47934 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CratP47934 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CratP47934 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms