Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tac1P41539 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tac1P41539 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tac1P41539 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms