Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighmbp2P40694 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighmbp2P40694 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms