Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp4P35123 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp4P35123 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp4P35123 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp4P35123 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp4P35123 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp4P35123 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp4P35123 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp4P35123 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp4P35123 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp4P35123 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp4P35123 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms