Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RxraP28700 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RxraP28700 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RxraP28700 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RxraP28700 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RxraP28700 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RxraP28700 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RxraP28700 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RxraP28700 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RxraP28700 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RxraP28700 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RxraP28700 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RxraP28700 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RxraP28700 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RxraP28700 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RxraP28700 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RxraP28700 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RxraP28700 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RxraP28700 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RxraP28700 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RxraP28700 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RxraP28700 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RxraP28700 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RxraP28700 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RxraP28700 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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