Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Marcksl1P28667 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Marcksl1P28667 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms