Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NapbP28663 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NapbP28663 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NapbP28663 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NapbP28663 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NapbP28663 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NapbP28663 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NapbP28663 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NapbP28663 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NapbP28663 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NapbP28663 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NapbP28663 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NapbP28663 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NapbP28663 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NapbP28663 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NapbP28663 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NapbP28663 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NapbP28663 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NapbP28663 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NapbP28663 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NapbP28663 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NapbP28663 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NapbP28663 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NapbP28663 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NapbP28663 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NapbP28663 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NapbP28663 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NapbP28663 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NapbP28663 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NapbP28663 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NapbP28663 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NapbP28663 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NapbP28663 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NapbP28663 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NapbP28663 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NapbP28663 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NapbP28663 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NapbP28663 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NapbP28663 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NapbP28663 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NapbP28663 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NapbP28663 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NapbP28663 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NapbP28663 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NapbP28663 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NapbP28663 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms