Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfraP26618 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms