Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc1P19123 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms