Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp53P15975 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp53P15975 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp53P15975 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp53P15975 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp53P15975 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp53P15975 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp53P15975 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp53P15975 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms