Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fv4P11370 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fv4P11370 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv4P11370 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms