Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl2P10148 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl2P10148 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms