Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3cP0DOY1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms