Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna5P07349 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna5P07349 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna5P07349 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms