Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrlP06879 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrlP06879 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrlP06879 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrlP06879 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrlP06879 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrlP06879 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrlP06879 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrlP06879 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrlP06879 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrlP06879 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrlP06879 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrlP06879 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrlP06879 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrlP06879 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrlP06879 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrlP06879 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrlP06879 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrlP06879 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrlP06879 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrlP06879 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrlP06879 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrlP06879 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrlP06879 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrlP06879 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrlP06879 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrlP06879 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrlP06879 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PrlP06879 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrlP06879 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrlP06879 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrlP06879 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrlP06879 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrlP06879 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrlP06879 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrlP06879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrlP06879 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrlP06879 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrlP06879 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrlP06879 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrlP06879 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrlP06879 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrlP06879 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms