Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01748 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01748 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01748 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01748 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01748 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01748 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01748 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01748 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01748 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01748 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01748 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01748 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01748 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01748 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01748 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01748 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01748 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms