Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd7O88665 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd7O88665 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd7O88665 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd7O88665 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms