Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pak1O88643 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pak1O88643 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pak1O88643 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pak1O88643 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pak1O88643 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pak1O88643 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pak1O88643 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pak1O88643 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms