Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma3O70435 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma3O70435 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psma3O70435 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma3O70435 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma3O70435 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma3O70435 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma3O70435 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma3O70435 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma3O70435 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma3O70435 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma3O70435 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms