Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc23O35125 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc23O35125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc23O35125 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms